世界發生了翻天覆地的變化。

2019年12月，東京都爆發了一種未知病毒引起的新型傳染病，並迅速蔓延到全國，同時該傳染病致死率高達40％遠超過伊波拉出血熱的致死率。

國際出入境也因此受到限制，特別是通往感染者數眾多的東京都的主要道路已被封鎖。

換言之，這是首都封鎖。

在沒有有效治療藥物的情況下，感染蔓延從一般市民開始、擴散至醫療人員、警察和自衛隊員，最終甚至蔓延到國家的核心。

當時的內閣總理大臣、內閣官房長官和衛生勞動大臣等主要官員相繼感染，最終因此成為了無法歸來的人。

此時日本國內死亡人數已超過20萬人。

在高度戒備的情況下，一個臨時政府崛起，同時一名發現了對新型傳染病的治療方法，拯救了許多重症患者生命的前感染症專家，被選為新的內閣總理大臣。

新總理提出了一系列應對新型傳染病和經濟的措施，每一項措施都取得了成效。

感染者人數逐漸減少。

最終，這場肆虐各地的新型傳染病疫情結束了。